The name "Haqqaniyah" (حقانیہ) means "one who is connected to the truth". Based on this meaning, it is permissible to use this name.
Allah the Almighty knows best.
Darul Ifta Al-Ikhlas, Karachi.
فیروز اللغات: (ص: 605، ط: فیروز سنز)
حقانی...حق سے نسبت رکھنے والا
حقانیت...خدا کی طرف منسوب ہونا۔سچائی۔راستی۔صداقت۔