"Naqee" (نَقِی) means pure and clean. This name is permissible to use.
Allah the Almighty knows best.
Darul Ifta Al-Ikhlas, Karachi.
المعجم الوسيط: (950/2، ط: دار الدعوة)
(النقي) الْخَالِص والحواري الدَّقِيق الْجيد
القاموس الوحید: (ص1330، ادارہ اسلامیات لاہور)
النقی: صاف، خالص، میدہ ج: نقاء وانقیاء